As suas actuações têm merecido o elogio da crítica, dela se escrevendo:
“ Margarida Prates deu um excelente concerto ontem na Cidade da Guatemala, acompanhada pela Orquestra Sinfónica Juvenil Municipal. A sua actuação foi estrondosa. A maneira como Margarida Prates sente e respira a música e como transmite esse sentimento para o piano é admirável. Ela criou uma fantástica ligação humana e musical com a Orquestra e com o Maestro, ligação evidente em palco durante todo o concerto” (Direcção do Museu Ixchel, Cidade da Guatemala, Agosto 2012)

“ Com um programa inteiramente dedicado ao romantismo a pianista conquistou o público com a sua musicalidade” (Diário do Sul, 2009)

“ Pianista aromática, confiante, cheia de sentimento. A sua interpretação chegou directa ao coração dos ouvintes”(Ute van Sanden, Mitteldeutsche Zeitung, 2008)

O seu percurso académico teve início no Instituto Gregoriano de Lisboa, licenciando-se depois na Escola Superior de Musica de Lisboa. Posteriormente, seguiu para Roma, onde frequentou os cursos de aperfeiçoamento pianístico com o Pianista Fausto Zadra, na Scuola Internazionale di Pianoforte. Em 2013 ingressa na Academia Internacional de Piano Aquiles Delle Vigne, onde obtém, em 2016, o “Diploma de Artista”.

Participou em vários concursos de piano a nível nacional e internacional, tendo sido laureada no Jugend Musiziert, no Concurso Internacional de Música do Estoril, no Corso-Concorso di Brescia / Itália e no Tournoi International de Musique | Paris.

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Tem tido uma prolífica actividade como pianista solista, apresentando-se em Portugal e no estrangeiro. Dedica ainda especial atenção à música de câmara, tendo já tocado com diversos agrupamentos, destacando-se um particular interesse pelo reportório para flauta e piano.

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Colabora regularmente com a Orquestra de Câmara de Cascais e Oeiras.

Paralelamente à sua actividade concertística, Margarida Prates interessa-se pela área da investigação musicológica, o que a levou a ser convidada pela RDP/Antena 2, a realizar programas radiofónicos dedicados a diferentes temas, como A história do teclado (2008), O feminismo na música (2009), António Fragoso e os seus contemporâneos (2012), António Fragoso, biografia musical (2018), O imaginário infantil na História da Música (2022).

Em 2018 participou no documentário cinematográfico “A vida breve de António Fragoso”, produzido pela RTP 2, por ocasião do centenário da morte deste músico português.